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暑期大学生夏令营训练心得体会(武汉大学)

编辑:物业经理人2022-04-15

  暑期大学生夏令营训练心得体会(武汉大学)

  快要离开NIBS了,心中确实不舍。这短短一个多月对我的影响很大,仿佛有种打开了新世界大门的感觉,尽管新世界并不一定与想象一致。所以,如果说我有什么感想的话,最多的应该是感恩吧。

  我最感激的是实验室的老师与师兄师姐。来NIBS的第一天,黄牛老师不仅饶有兴致地听完了我对课题的设想,而且还特别根据我想做的东西,安排了曾经做过类似课题的孙汉资师兄带我。接下来的日子里,我在师兄师姐的帮助下学会了如何使用Gromacs、Amber两种分子动力学模拟软件,学会了进行MD、SMD、Umbrella Sampling以及MM-PBSA分析,并使用gnuplot、VMD、Chimera等工具来画图、分析结果数据等。最终也就我感兴趣的chaperone蛋白-核酸相互作用,特别是其中的熵传递,做了些许工作。虽然这些工作并不能算得上严格的科学研究,毕竟一个月时间太短,而计算领域的结果需要在研究者完全熟悉软件原理、参数等的情况下才具有可信度,但是这个过程中学到的、感悟到的东西才是真正重要的。

  正如所有的科研工作都不是一蹴而就的,学习的过程也是。

  一开始,汉资师兄打算让我先掌握MD的基本流程,于是安排我就着Gromacs的tutorials来一步步把跑simulation的步骤给过一遍。紧接着,汉资师兄很nice地跟我讨论了我想做的课题,提出Umbrella Sampling也许能够提供蛋白-核酸相互作用这个秒级过程的信息,于是我也开始就这部分进行学习。这整个过程并不简单,因为,我在此前基本没有接触过Linu*系统,编程语言也只学习过最基础的C,R语言也仅仅是自学过一段时间。但是要运行Gromacs首先要学会基本的Linu*系统操作,而其中的几个关键步骤更是需要对Python、Perl等语言有基本的理解。因此一开始我就陷入了一个困境,无论是对Linu*系统的完全掌握还是对Python、Perl脚本编程的掌握,任何一个都需要花费1个月以上的时间。此时,实验室的其他学长给了我个很好的建议:即学即用。先想好你要做的是什么,然后Google一下,立即依样画葫芦解决问题。可以说,没有这个思想的启发,我无法在这短短一个月时间内高效地学到这么多东西。然而,犹如Perl跟Python语言编程这种难度的内容,确实没办法很快掌握,我也在需要用到这些内容的地方stuck了2-3天。这时,汉资师兄给了我个很好的建议,如果这些Perl、Python脚本解决的问题并不是那么复杂,为什么不用相对简单的Shell脚本替代它呢?于是,我花了2天左右研究如何进行Shell脚本编程,后来也在不断使用中练习这种编程方式,最终不仅可以用Shell替代部分的原脚本,也使后来的各种工作的速度显著提升。

  然而,当我掌握了在Gromacs中跑MD与Umbrella Sampling后,我意识到,它们都只是拿到结果的方式,如何对结果进行分析才是我下一步要解决的问题。与汉资师兄讨论后,他告诉我,熵并不是计算中值得关注的值,因为它对体系、算法等太敏感,而且较难通过实验直接测得,所以难以印证。但是他仍然给我指了一条路--Amber的MM-PBSA分析,并鼓励我不要放弃自己的想法,说不定PhD时还能再试(2333333)。后面我就在折腾Amber的MM-PBSA分析的同时研究如何搭建自己的体系了。首先我选取的典型chaperone之一的NC具有两个锌指结构域,而力场设定的作用力并不足以模拟并稳定天然的锌指状态,因而必须对8个配位键施加restraint。加之restraint的施加在Gromacs与Amber中的方式是不同的,所以我花了几天时间在这上面。另外,由于NC是个小蛋白,PDB中NC-ssDNA复合物的结构是由NMR得到的,这种结构文件常具有多个Model,因此需要另外写脚本予以拆分。克服了这些困难之后,我一方面参考官方网站上的指导与说明以及其他参考文献的记载来设置参数,另一方面向其他学长学姐请教经验,不断地设置更优的参数、换用更稳定的版本、debugging,终于做成了一些东西。

  其实我想感谢的还有很多,包括在组会上进行指导的黄牛老师,让我明白了如何更好地进行学术演讲、如何开始一个研究并在遇到困难时想其他方法克服,也让我了解了这个领域、见识了生物学、药学、计算科学、有机化学等学科相互交织的神奇;包括在年会上发表了精彩演讲的各位老师,让我领略了什么是好的科研、什么是开创式的新思路,也让我知道了各领域的前沿状态;包括其他summer students,陪伴我度过了这愉快的一个月,跟我探讨科学问题,也让我看到了自己某些方面的不足......

  真心感激在NIBS这段美好的岁月,它将常伴我心,温暖、照亮我今后踏足科研的道路。

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篇2:暑期大学生夏令营训练心得体会(山学,袭荣文实验室)

  暑期大学生夏令营训练心得体会(山东大学,袭荣文实验室)

  一个月的NIBS暑期训练已经接近尾声,经历了我所想要经历的生活,得到了我所想要得到的答案。在这里,我强行把自己沉浸在Science的世界里,希望能够给自己找到一个从事生物领域研究工作的理由。

  我这么小心眼儿,怎么学生物?

  来到NIBS这几天,我心里特别纠结,几乎快要有心理疾病了。我说话,我以前的确没有接触过什么危险的东西,也没一种自我保护的意识。我进入实验室的第一天就开始学习PCR和跑胶电泳,也是第一次意识到EB、DAB、SDS的一级致癌性。以前也听学长说过EB的毒性,但是自己没有去接触,所以了解不多。 我小心眼儿,这个缺点困扰我好长时间,当初为了小狗要了一下鞋,就要去打狂犬疫苗,现在都觉得好笑。可是,心理障碍往往是最难克服的。开始第一次胳膊碰到了污染容器,纠结一天。又担心被电泳池中的水溅到,又纠结好几天。结果就是,配个胶、跑个胶简直紧张到死,每次做完实验都是满头大汗。我一直想要克服这种障碍,可是就是做不到,久而久之就不想做这种实验。我觉得实验熟悉了之后可能还会好一点吧!有时候,怕师兄师姐笑话,就自己偷偷地做实验、洗手。我问自己好多次了,你这么小心眼儿,怎么做生物、化学相关的实验呢?其实吧,大一准备转专业的时候,选择了金融和财政这两个和生物差距十万八千里的专业,就是想摆脱这种比较危险的科研工作,可是最后犹豫之后,还是待在了生命科学学院里面。我现在依然不清楚该怎样去克服这种心理障碍,我觉得实验操作熟悉之后,便不再顾虑太多了,还有就是做一些神经性、行为性方面的研究。

  什么是差距?这就是差距。

  这是我来NIBS的第一印象,不得不说,NIBS的科研条件和科研环境绝对居于国内领先水平。所里有这么多的实验室和辅助中心,涉及到了很多前沿的生物学研究领域。并不是说我把科研的中心全部压在经费和设备上,而是要想完成一项尤其是创新性的工作,设备很重要。我们学校的实验室几乎都是教师改造的,实验室前面还有一个大黑板。所以,一个完善的环境、一个完全的制度是一个完美的成果的必要条件。当然,这些设备并不是轻而易举的,你需要能力、需要证明你的实力。归结到最后,终究还是归于自己。你拥有创新意识、灵敏的思维、扎实的能力才有机会拥有一个完备的平台。

  没有对比,就没有伤害。

  山东大学也算是一个不错的学校,但是和其他summer相比,感觉自己太low了。生物学嘛,首先就要考虑创新意识、科研能力。在这里听了好多的学术报告会,会后大家都会谈论一下自己对内容的理解,每次我都只会说我只听出来了这项研究的大体课题,但是涉及到方法、问题、思路上的内容,自己则像一个白痴一样,顿时感觉自己的那种英语水平、科研意识、创新能力和别热差得远呢。年会期间,有卡拉ok大赛、羽毛球比赛、乒乓球比赛,我却无一擅长,有时候真的感觉自己好差啊。就像王所说的,千万不要学青蛙,不要坐井观天,要把视野放出去,放到全国、全世界。

  学英语啊。

  这是我对生物学的第一印象,英语无处不在。其实这不是来到NIBS之后才有的意识,刚刚进入大学,学习专业接而成的时候,发现英语无处不在。只不过是,来到NIBS后,这种感觉更将强烈。刚开始,做试验前,刘博给了我几篇paper,完全看不懂。其实到现在我还是看中文课本,不喜欢英文课本,看来这个习惯要改改了。另外就是报告会,现在大多数学术报告都是英语的,根本听不懂啊,喂,看来以后天天是离不开英语了,写到这,又该去看怕热了。

  我到底喜欢什么?

  我一直在问自己一个问题:我真的对生物学感兴趣吗?进入大学以来,接触生物科学也有两年时光了,说实话,中途不止一次想要放弃这种科学家的梦想,学习金融、贸易这样的经济专业,可是犹犹豫豫下也坚持到了现在。生物科学是条崎岖的路,在这条路上,你的付出不一定有回报,你的研究极易脱轨实际应用,但是,他是神圣的,有时候回报远大于付出,有时候实际应用造福世界,有时候他甚至成为一种赌博,输了默默无闻,赢了功成名遂。

  如何做一名科研工作者?

  我的创造力在哪?视野要放在哪?

  其实,到现在才真正感受到了科学研究是一种什么样的工作,枯燥中塑造完美。我一开始接触的是一大堆分子技术,IHC、HE、PCR等等,觉得生物真无聊,简单重复,但是当我把自己所做的实验放在一个大课题、大背景下的时候,会发现这种实验设计果然巧妙,环环相扣去探寻一种生物模型,这时又会觉得生物的奇妙魅力。

  生物医学,我想实现生物与医学的更好衔接。

  两年以来,我一直试图去寻找生物学研究的意义在哪?或许这次我找到了答案。李文辉老师一直在进行乙肝病毒方面的研究,寻找乙肝受体,研究其感染机制,寻找药物抑制HDV的感染,也许有一天成功解决乙肝这一世纪难题。另外,z老师的研究我觉得是一种生物制药,通过对其他实验室的基础研究发现的具有医学疗效的小分子加工、修饰、扩增,使其成为真正的临床药物。我一直有一个疑问,我们生物学做了这么多的研究,发现了这么多疾病抑制剂,为什么不能发展为临床药物呢,我今天才明白,科学到医学的这个跨越,并没有我们想象中的那么简单。动物和人体存在遗传性差异,而且治疗手段也好,药物也好,一定要有充足的安全性、保障度和稳定性,这些在基础研究中是很少考虑到的。

  最后,我想成为一种奇迹,它的内容在未来。

篇3:暑期大学生夏令营训练心得体会(吉大)

  暑期大学生夏令营训练心得体会(吉林大学)

  转眼间,我们的暑期活动已经过去大半。从家里收拾行囊、来到北京好像并没有过去很久的样子。不到五周的暑期活动真的让我对生活有了不同的认识,让作为准大三学生的我开始去思考以后,而不是懵懂地生活下去。

  作为一个在本地上大学的学生,这五周是我从小到大离家最久的一次。7月18号的上午,我们正式开始了为期五周的暑期活动。在这五周时间里,杜老师分别为我们设计了小的实验课题。虽然有老师的耐心讲解,但是拿到课题的时候依旧感觉到茫然。即使在学校有着一定的实验基础,但想要理解裂殖酵母自噬这一从未接触过的领域,还是感觉到了前所未有的困难。和以往接触过的实验不同,我的这份课题从设计思路上就有很多巧妙之处,在难度上也超过了以往的实验,并且关于裂殖酵母自噬的机理本身就有大量难以理解的部分。为了深入去理解我的课题,我开始试着阅读相关的文献,但是收到的成效甚微,许多专业的词语,专业的实验方法,都是通过长期的积淀才得到的,这让我感受到了前所未有的失落。而最后,我并没有坚持阅读文献,而是先去反复钻研老师为我设计的实验课题,通过不断思考推测,并与师姐讨论以此来理解这份艰难的实验计划,随着实验的进行与经验积累,当我重新阅读相关文献的时候,可以有针对性地选择相对有用的信息去验证我的推测,不断推翻自己的推测,并不断尝试新的推测这大概是我在目前的理论知识部分最大的收获。

  在实验操作方面,我得到了师姐的许多帮助与教诲。虽然一直在跟随师姐学习记录,但是在实际操作的过程中依旧失误不断,强调过的注意事项,在实际操作过程中并不能时时注意得到,虽然在实验过程中常常被自己的健忘窘到。在师姐身上,我真的学习到了很多,最重要的便是认真的品质。在师姐做实验的过程中,我深切领略到了效率的重要性,在庞大的实验任务下,我感受到师姐不放过任何一点零碎的时间投身于实验中,大大节省了实验时间。随着时间的推移,我慢慢明白很多的事情都只是熟练度的问题,犯错的过程,便是熟练的过程,我们没必要去抓住出过的错不放手,更不可以无视犯过的错,一直相信自己会在不断的练习中成长起来。值得注意的是,这里的实验室聘用了三位工作人员为研究生们配制培养基,实验用品灭菌,这大大提高了实验室的工作效率。以往在学校里仅仅是这一部分的操作就要花去半天的时间,实验室为我们提供了一个做够便利的平台,去专心完成实验。

  其实,五周的生活对我来说不仅仅是实验思路的收获,更多的则是对大学生活的感悟。在学校里过多关注书本上的理论知识让我鲜少思考以后的路,而身处研究所这一个大环境,让我不得不去想。说实话,在我完全无法理解我的实验任务的时候,我感受到的是深深的失落,而学习到新的实验手法所带来的喜悦,大概也没有当我最后领会到实验思路时的喜悦来得强烈。每天晚上回到寝室都会听到许多小伙伴感慨自己在实验过程中频频出错,其实大家都在面对着同样的困境,困境的根源在于熟练度的不足。总有些失误在实验中真的难以避免,但选择了生物专业并来到这里的我们,相信都是抱着对它的热情而来,太过于去苛求一个结果,很多时候会让人丧失最初的热爱。当对现在的生活感受到疲惫的时候,试着去放松自己,试着回想起逝去的热情,去回想起当初努力调整显微镜而进入到微观世界时的喜悦,去享受现在的生活。

  这五周里,我怀疑过自己的慢性子是否真的适合去做一份科研工作,我甚至在这五周里曾经对未来的生活充满恐惧,但是就像我经历过却又被我遗忘过的那样,不论是怎样的自己,脚下总会有一条适合自己的路,不必拘泥于所谓的规则,更没必要苛求自己逼迫自己去把一切做得完美无缺。我也更不必为自己的未来而恐惧些什么,这是一颗自由的星球,我们尽可用自己喜欢的方式去活着,去追求。

篇4:暑期大学生夏令营训练心得体会(西北农大)

  暑期大学生夏令营训练心得体会(西北农大)

  为期五周的NIBS暑期培训行将结束,日益加深的感情酝酿了太多不舍,感慨颇多。

  Permission–小幸运

  得知邮箱收到NIBS回信的那一刻,心中欢腾的小鹿雀跃万分,这是得了多少幸运才让我踏上NIBS暑期之旅!因为得知消息较晚,在报名截止前一天才寄出的材料,忐忑不安,然而并没有影响我的permission,于是在收到通知的第一时间心生好感。

  同时也对给我转发NIBS暑期训练计划活动通知的学长充满感激。继而想到,也许NIBS的宣传力度可以再大一些,相信会有更多更优秀的summer来精彩这一个个夏天。

  Prelude–小心翼翼

  期待,紧张,兴奋,终于到了7月17号报道时间。第一次一个人搭上去往首都的列车,一片陌生与未知,不知等待我的NIBS以一种什么样的姿态相迎,不过它的确不是那么容易可以到达的地方,担心报道时间来不及,匆忙打电话给李老师,却是极温柔的肯定答复,瞬间心就定下来了。曲曲折折之后终于一睹NIBS真容,报道接触的几位老师态度都好温和好亲切,倍感踏实。

  下午的开营仪式让我们对北生所有了比较系统的了解,于是对此科研圣地充满敬畏;后面summer们分组做了简单介绍,也算是群英荟萃让我深感渺小的同时也燃起了斗志–绝对不能辜负此次NIBS之约!

  进入实验室第一印象,何老师和师兄师姐们都在自己的工作上忙碌着,实验室仪器高端齐全(人手齐备各种量程的“枪”、各种大小的离心机、随处可见的PCR仪、贴上各自名字标签的冰箱等等),准备工作细致周到(大姐统一灭菌的枪头、装好钢珠的PE管、不用自己清洗的试验用具等等),这些都不同于以前所见的实验室,真的是一个做科研的地方。

  初步了解,基本知识为分子生物学,我还没学过,很多仪器也还不会用,一切都才刚刚开始,怀着敬畏之心,谨言慎行,小心翼翼。

  Acquaintance–喜欢你

  与NIBS相交渐久慢慢熟悉了它,喜欢上它。

  位置上远离喧嚣可以静心科研,资源丰富PI很牛让人感觉底气十足,服务人员态度和蔼甚觉温暖(不管是食堂工作人员还是打扫卫生的大姐,都能感受到他们的友好与责任心),更重要的是实验过程中看到的日渐明朗感受到一步步的希望,是的,师兄师姐们毫无保留的教授与热情给人极大的不可磨灭的鼓舞与激情。

  年会上PI们的分享更是一场饕餮盛宴,虽然不怎么能听懂但是对我们意义非常;精心组织的KTV 、羽毛球、乒乓球比赛也是大放光彩,学术之外也可以玩得如此之嗨,居然可以目睹王所的小苹果引爆全场;王所与暑期学生座谈也是极为慷慨,大把时间献给我们深入剖析疑惑,感激!也是在年会,与师兄师姐们的交流更多,他们的分享给了我太多太多,关于科研,关于生活,关于准备,关于选择,感激!

  Goodbye–记忆

  马上说再见,我会一直想念。这是一段绝对不会被选择遗忘的记忆,因为珍贵,因为不寻常。

  NIBS,这里,收获了很多,看到了很多,学到了很多,谢谢!

篇5:暑期大学生夏令营训练心得体会(湖南大学)

  暑期大学生夏令营训练心得体会(湖南大学)

  “做科研是要耐得住寂寞的。”这是我在NIBS一月生活中感触最深的一句话。然我这二十余年的单身狗,想是会因着寂寞这老友结识下科研这个新朋友了吧!

  从接到通知那一刻就满怀欣喜与憧憬的,能有这万众挑一的机会来到北京这座驰名中外的研究所参观学习,结识一群才华横溢,志向高远的同学,见识最高端最新的实验室技术与数不清的生物界神级大牛们。我想我只差跟在后面要个签名了。

  研究所的整体环境是优雅而轻松的,也可以看出所里每年为了我们这些summer耗费了大量人力物力。这些都是希望我们能够毫无后顾之忧的全心投入到实验室繁忙而高效的实验中来。惭愧地说我本人实验基础与知识功底几乎算是暑期生中最差的,在整个学习过程中拖累了同实验室的同学与带我们的师兄师姐。对于实验室所做的果蝇相关的遗传学实验以及大量基础的分子生物学相关实验一点基础都没有,完全是从头学起,当时只恨为什么学校安排的分子生物学与遗传学为什么刚好下个学期才上啊!!

  不过多谢师兄师姐们毫无保留的认真细心的引领,在短短的几个星期实验室生活中,我初步掌握了一些构建克隆等分子生物学相关实验:PCR,跑胶,胶回收,In-fusion,酶切鉴定,识别果蝇身上的平衡子性状等等等等。在那个凌晨近一点寂静无声的实验室中,我与阿为静静看着师兄做实验的时候,我想到那句“做科研是要耐得住寂寞的”。你需要独自完成一连串繁琐而复杂的实验,耗尽一个又一个的日日夜夜,将自己浮躁无所适从的心渐渐沉淀下来,沉静在思绪中与实验室融为一体。

  我想最重要的不是我学到了哪些新的实验技能,而是我从那些十分厉害却仍辛勤奋斗的师兄身上,从那些享誉中外却从不停止探索创新的PI身上。见到了身为一个学者,一个科研人员所应该具有的永不气馁,静心学术,辛勤探索的态度与精神。

  活泼欢快的娱乐生活自然也是充实着我们的暑期生活中的,一楼健身房的羽毛球场乒乓球场经常活跃着我们奔跑跳跃的身影,北京后湖的酒吧里也有师兄深情的一首“飘洋过海来看你”。还有那年会上大家精彩绝伦的节目,美丽怡人的山庄风景.....太多太多的欢声笑语回荡在记忆深处。

  站在北京郊外一片蓝蓝的天空下,望着那青葱树影后屹立的研究所,我想我是不会忘记这里,不会忘记这里有一群可爱而才华横溢的人的。

  13.霍妙哲(四川大学,陈良实验室):

  这个暑假于我而言是最特别的假期,我成为了NIBS暑期训练学生的一员,这一个月里,自己突然从“上学”变成了“上班”,多了一种前所未有的使命感--前者是汲取知识,求输入,目的是自我塑造;在研究所工作,既要不断学习充电,要钻研,又要有新创造,旨在为人类的知识殿堂添砖加瓦。

  NIBS究竟是一个什么样的地方?

  中国做生物科学研究的理想之地--毫不夸张!NIBS给所内的人员创造了得天独厚的条件:一方面在科研工作上提供了优质而高效率的设备和试剂,得“地利”,做实验绝不会为实验条件不佳而困扰烦心,从而做到专心又放心。至于生活上......我相信同行的summers都会对这里的食堂念念不忘,住宿条件也是让我幸福感倍增。除此之外,干净整洁的办公室、舒适的休息区、图书馆、健身房一应俱全。NIBS尽其所能,让每个人都能无后顾之忧的学习、工作,也让这里的环境更加纯粹,这些实在难能可贵。

  研究人员当然也不辱使命,每年来自NIBS的成果就是最好的答卷。多数人在所时间超过7×12h,为科学奉献着自我,这样的付出,辛苦但能不断激发斗志,热爱科研的人,自然孜孜不倦,乐在其中。

  为什么要做科研?

  这是一个让我纠结许久的问题。“求知”可以是个人兴趣,但深究“做科研”,就不该单纯以“满足好奇心”作为全部动力了。有时我会想得功利一些:一是相比传统行业,做科研难有钱途,科研值得我们做出这种物质上的“牺牲”吗?再者每年生物领域成果如此多,其实多数是不受外界关注的枯燥数据、相当一段时间内难以得到应用的发现,其背后也是大量的汗水、聪明的头脑、科研工作者的热情与期待......然而这些工作的价值有多大呢?

  如今,我在NIBS找到了答案。在这样的环境里,成为科研工作者不意味着生活清苦,如今社会也越来越支持给予科学家奖励,尊重知识、尊重科学是中国发展的趋势。那么,有了一定的生活水准之后,相比再追求更多金钱,探索新知的精神享受难道不更令人愉悦吗?至少我是这样想的,我相信众多辛勤的科研工作者也是如此认为的--正如晓东所长之言“科研生涯的财富是无形的财富......(做科研)在迷雾中寻找亮光,那是一种沉浸式的快乐。”

  至于看似重复的科研工作价值何在的问题,这段时间与各位从业者的近距离接触给了我新的启发:我可能花费数年的时间与精力,只是做了一些微小的工作,我的同行也是,根本不足以解决人类现在的困境,然而我们有着集体的力量与智慧,微小的工作累积起来,就是新突破。如果我们的先人因为受到质疑“学科学有什么用呢,你还能上天吗?”而放弃研究所谓高深无用的数字和图形,那么今天的我仍然只能呆呆地猜想玉兔是什么样子。

  现在,我们还想知道更多。

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